http://goo.gl/BFXWe

リンク先のとおりですが、MySQLで突然テーブルがクラッシュすることがあります。
リンク先ではMyISAMを利用時みたいで、実際にMyISAMテーブルで記載の通りの事象に見舞われました。

そんなに頻繁にテーブルクラッシュしたわけではないのですが、今回1万を超えるテーブルの中から200近くのテーブルがクラッシュして対応が大変でした。

記述では、

最近のエラーログの中の restarted mysqld メッセージを探せば簡単に検証する事ができます。もしそのようなメッセージがあれば、破損の原因はサーバーの破損によるものである可能性が高いでしょう。そうでなければ、破損は通常作業の最中に起きたという事になるでしょう。その場合はバグです。

ってなってますが、簡単にバグですって言われても (^^ゞ
ORACLEさん頼みますよって感じ。

結局原因は不明。
ログにはクラッシュした旨のメッセージは出ますが、クラッシュしたタイミングでエラーは出ないみたい。
# クラッシュしたことによりテーブルの更新ができない場合にメッセージが出る

InnoDBでは発生しないのはトランザクションがあるからかしらね？
もし、そうならやっぱりInnoDBを使うことがデフォルトでありたいわね。